在AAV病毒(du)包(bao)裝(zhuang)的三(san)質(zhi)粒(li)系統中(zhong),質(zhi)粒(li)比(bi)例的優化對病毒(du)滴度、空殼(ke)率和(he)包(bao)裝(zhuang)效率十分重要(yao)。那么(me)在三(san)質(zhi)粒(li)包(bao)裝(zhuang)系統中(zhong),怎么(me)樣才能得(de)到(dao)正確(que)的三(san)質(zhi)粒(li)比(bi)例,達到(dao)理想(xiang)的病毒(du)包(bao)裝(zhuang)效果(guo)呢?很多老師可能都曾(ceng)被(bei)這(zhe)個問(wen)題困擾過(guo),小編現(xian)在就分享(xiang)一些在病毒(du)包裝過(guo)程中(zhong)會(hui)用到的一些小技巧(qiao)。
首先,AAV的包裝依賴于以(yi)下三種核心質(zhi)粒(li)的協同(tong)作用:
攜(xie)帶目(mu)標基(ji)因(兩(liang)側為ITR序列)及調(diao)控元件,決定病毒基(ji)因組內容
提供腺病毒輔(fu)助基因(E2A、E4、VA RNA),支持病毒復制與包(bao)裝
編碼AAV復制(zhi)蛋白(Rep)和(he)衣殼(ke)蛋白(Cap),決定血清型和(he)組織靶向(xiang)性(如(ru)AAV2、AAV9)
二、三質粒比例對病毒包裝的影響
? 經典比例:1:1:1(等摩爾比),但需根據實驗體系調整(方式見下文)
? 優化調整:部分血清型或大片段基因需提高載體質粒比例(如2:1:1),以平衡Cap蛋白與基因組供給
? 比例梯(ti)(ti)度:以1:1:1為(wei)基礎,設(she)置載體(ti)質粒梯(ti)(ti)度(如1.5:1:1、2:1:1)和Rep/Cap梯(ti)(ti)度(如1:1.5:1)
? 固定參數:總質粒量(liang)恒定(如2 μg/孔(kong)于6孔(kong)板),轉染試(shi)劑(PEI)與DNA質量(liang)比(bi)2:1
? 病毒滴度(du):通過qPCR、ddPCR(基因(yin)組滴度(du))或其(qi)他方式進行轉染滴度(du)量化
? 空殼率:透射電(dian)鏡(jing)(TEM)或ELISA檢測完整(zheng)病毒顆粒比例
? 細胞(bao)毒性:轉染后48-72小時觀察細胞(bao)形態,CCK-8法測(ce)定存活率
AAV包(bao)裝容量為4.7kb,若目的基因(yin)(如(ru)大(da)片段基因(yin))接近此閾值,需減少非必需元件(jian)(如(ru)長(chang)polyA尾)以騰出空間。此時(shi)需增加輔助(zhu)質(zhi)粒(Rep/Cap質(zhi)粒) 比例,確保衣殼蛋白充(chong)足支持包(bao)裝。
示(shi)例:包裝4.2kb基因(yin)時,建(jian)議Rep/Cap:載體質粒=2:1;若(ruo)基因(yin)增至4.5kb,可調整為2.5:1。
用熒光報(bao)告(gao)基因(如GFP)替(ti)代目標(biao)基因,快速評估轉染效率(>70%為合(he)格)
在6孔板中測(ce)試3-5種(zhong)比例,收集上清檢測(ce)滴度(目標>1×10? vg/mL)
選(xuan)擇合(he)適比(bi)例擴大至T75或搖(yao)瓶培養,驗證重復(fu)性
? SDS-PAGE:檢測衣殼蛋(dan)白完整性(VP1/VP2/VP3比例)
? qPCR/ddPCR:確認基(ji)因組包裝效率,排(pai)除ITR序列損傷(shang)
? 質粒質量:質粒純度要足夠高(OD260/280≈1.8-2.0),避免內毒素污染(<0.1 EU/μg)
? 轉染試劑推薦:PEI MAX/GMP級MAXgene
? 血清型推薦(部分):
(1)神經系統:推薦AAV9、PHP.B
(2)肝臟靶向:推薦AAV8
(3)肺部遞送:推薦AAV5或AAV6
? 轉染試劑配比:PEI與質粒質量比建議為 2:1,孵育時間控制在10-20分鐘
? 細胞狀態:使用對數生長期、低代次(≤30代)的293細胞,貼壁系統待匯合度約85%時轉染效果更佳
? 收獲時間:AAV通常在轉染后72小時收毒,此時病毒滴度達到峰值
通過系(xi)統性梯度實(shi)驗、血清(qing)型特異性調整和(he)嚴格(ge)的質控(kong),可(ke)篩選出合適的三質粒系(xi)統比例,有助于提(ti)升AAV包裝效率,降低空殼(ke)率與(yu)細胞(bao)毒性,從而為基因治(zhi)療研(yan)究(jiu)提(ti)供高滴度、高完整性的病毒載(zai)體。
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